亞馬遜云科技助力科學(xué)家發(fā)現(xiàn)13萬種新RNA病毒
3月9日消息，據(jù)報道，亞馬遜云科技宣布近期與加拿大不列顛哥倫比亞大學(xué)云創(chuàng)新中心（UBC CIC）達(dá)成合作，基于亞馬遜云科技構(gòu)建的超級計(jì)算平臺，助力國際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)在11天內(nèi)搜索了近600萬份公開可用的生物樣本，成功識別出超過13萬種新的RNA病毒，其中包括9種新型冠狀病毒。
據(jù)了解，在亞馬遜云科技助力下，UBC CIC團(tuán)隊(duì)和全球計(jì)算病毒學(xué)家啟動了The Open Virome（開放病毒組）項(xiàng)目，創(chuàng)建了開放的病毒發(fā)現(xiàn)云計(jì)算平臺Serratus。目前，該研究成果已經(jīng)發(fā)表在科學(xué)雜志《自然》上，同時還創(chuàng)建了公開的病毒數(shù)據(jù)庫，向全球科學(xué)界分享研究成果，幫助加速對RNA病毒的研究。
據(jù)介紹，The Open Virome項(xiàng)目的研究人員僅用8周時間，順利地在亞馬遜云科技上構(gòu)建超級計(jì)算平臺。借助亞馬遜云科技彈性計(jì)算能力，他們能夠快速處理數(shù)百萬GB的數(shù)據(jù)。該團(tuán)隊(duì)在亞馬遜云科技Amazon Simple Storage Service（Amazon S3）中鏡像了病毒基因測序數(shù)據(jù)庫SRA，之后使用亞馬遜云科技彈性計(jì)算云實(shí)例Amazon Elastic Compute Cloud（Amazon EC2）來分析數(shù)據(jù)集。
最終，在11天內(nèi)，該團(tuán)隊(duì)處理了高達(dá)570萬個測序數(shù)據(jù)集，僅花費(fèi)了2.4萬美元，發(fā)現(xiàn)了13萬個新的RNA病毒。在此之前，科學(xué)家們經(jīng)過幾十年的數(shù)據(jù)分析，只發(fā)現(xiàn)了1.5萬種病毒。
另外，通過基于亞馬遜云科技搭建的Serratus平臺，研究人員相信他們既能識別潛在的有害新病毒，又能提醒科學(xué)家注意導(dǎo)致新冠肺炎病毒SARS-CoV-2 virus的潛在突變，幫助改善診斷測試和疫苗開發(fā)，為醫(yī)療政策決策者提供更有效的指導(dǎo)。
（圖源UBC官網(wǎng)）
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